1、旧的vcf文件走的是标准的bwa+gatk流程，参考基因组是hg19，新的文件参考基因组是hg38，也是gatk标准流程想有比较它们，首先；VCF文件本质上是文本文件，可以用Windows当中文本编辑器软件打开，比如editplus等由于VCF文件往往很大以G为单位，如；注释信息部分 下图展示的是vcf格式文件的注释信息部分截图第一行##fileformat=VCF41，主要说明格式的版本表头信息 上图展示的是vcf格式文件的注释信息部分截图第一行##fileformat=VCF41，主要说明格式的版本变异信息 vcf文件中除上图中的内容外，剩下的每一行都记录一个变异位点的具体信息常见的变异类型主要包括SNP，insert和del。